Le fanerogame marine costituiscono uno degli habitat di maggiore pregio nell’intero Mar Mediterraneo. Tutte le specie di fanerogame marine sono considerate meritevoli di salvaguardia e conservazione come specie o habitat e sono elencate in accordi/convenzioni internazionali volti alla protezione della biodiversità marina.
Le specie aliene possono rappresentare una grave minaccia per le popolazioni native.
In Giappone alcune specie aliene di pesci come ad esempio il bluegill (Lepomis macrochirus) possono rappresentare una minaccia per gli insetti acquatici.
Le invasioni biologiche consistono nell’arrivo, sopravvivenza, riproduzione e dispersione di una specie in un ecosistema dove la specie non esisteva in precedenza (Carlton 1989).